江南湖南疾控已完成20例新冠病毒标本测序,均为德尔塔毒株,与南京高度同源—新闻—科学网

时间:2024-04-28 22:33:20 已阅读:77次

四川日报 新四川客户端8月2日讯 (记者 张春祥 通信员 张亚娜 李世康) 记者今日获悉,自7月28日拿到我省2021年第一例本土新冠肺炎病例标本以来,四川省疾控中央已经完成20例德尔塔新冠病毒基因组测序。已经经完成测序成果的标本均为德尔塔毒株,与南京高度同源。

5天时间已经完成20例标本测序

据省疾控中央查验科科长湛志飞先容,基因组测序可于第一时间获取新发未知病毒的基因组序列信息,已经成为研究疾病暴发的主要东西。经由过程构建进化树,研究差别患者病毒遗传序列变迁,能于份子生物学层面展现病毒的流传体式格局,阐发新冠病毒的进化来历,研究新冠病毒的致病病理机制,为节制疫情暴发提供科学依据。

经由过程检测新冠病毒的全基因组序列,再将这个序列经由过程算法与数据库中的数据举行比对于,可以开端判定其地区来历。将序列与既往病例序列举行比对于,假如序列于统一进化树分����APP支上,则可以判定这些病例是否来自统一流传链或者感染源。

面临这次疫情,从7月28日拿到四川省2021年第一例本土新冠肺炎病例标本以来,四川省疾控已经完成20例标本测序。

24小时完成病毒基因测序溯源

新冠病毒样本送到试验室后,正常需要颠末多个步调完成检测。 湛志飞称,于接到阴性样本后,事情职员起首举行复核事情,对于样本举行核酸提取,再用两种试剂举行核酸检测。复核阴性的标本,别离用二代以及三代高通量测序技能举行序列测定,为病毒溯源事情设置 双安全 ,确保满有把握。

病毒基因序列测定完成后,事情职员还要立刻举行生物信息学阐发,将病毒序列与数据库中的序列举行比对于,查看有没有变异位点,举行同源性比力。完成数据比对于后,还要实时撰写溯源陈诉。

今朝,四川省疾控中央已经具有新冠病毒基因组高通量二代以及三代测序威力,为四川省新型冠状病毒疫情和其他感染病病原体的鉴定以及溯源、防控应答提供了强盛的技能支撑。 湛志飞先容,去年10月份才把握这项技能,之前都是送到国度疾控中央检测。今朝四川省疾控中央造就了3名技能主干,所有的新冠病毒基因组测序都能于24小时内完成,环境繁杂的也不会跨越48小时。按照疫情的变迁,只有有标原来,城市于24小时内启动测序流程。

测序成果与南京高度同源

7月28日,接到2021年第一例本土新冠肺炎病例标本测序事情以来,省疾控中央当即构造专业技能职员,昼夜不断地开展测序事情,经由过程文库制备、簇天生、上机测序与数据比对于阐发,已经经完成测序成果的标本均为德尔塔毒株。从国度疾控中央反馈的成果显示,以及江苏省报送的南京疫情本土病例新冠病毒基因组序列高度同源。

按照最新疫情传递,2021年7月20日0时至8月1日24时,四川省累计陈诉新型冠状病毒肺炎确诊病例22例(境外输入3例)。这次疫情病原体为德尔塔变异株,规模广、来势猛,泛博平易近众必然不克不及失以轻心,严酷履行好持码进出、丈量体温、佩带口罩、连结间隔等办法,有用降低病毒流传危害,削减没必要要的职员堆积。

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